補足です。
タスクマネージャでchromeが起動している状態を確認すると、なでしこエディタで起動した場合、chromeの子プロセス数(27個)に対し、同一内容を実行ファイルで起動した場合は、約2倍(58個)となっています。余分なchrome子プロセスが残ってように見えます。